河东平叛受阻的消息，更加恼火。纳言高辅恰好伴驾在侧，进言道：“将帅不和，素为用兵大忌。段、樊不睦，岂能齐心协力讨平贼寇？必去其一，使二公不得相互掣肘，事乃可成。”
“段思廉本无征讨之责，却来多管闲事，便命他速归太原，不得干预。征剿之事，仍命樊尚书总之。”
高辅道：“樊公专征虽有敕在先，但焚村坑降之事，已令百姓怨声载道，如此进剿，恐如汤公所言，愈剿愈烈，平定无期。”
史元**不**地瞥了一眼，问：“莫非欲朕罢免樊子盖，以段思廉代之乎？”
高辅道：“临阵易帅，本兵家大忌。然臣以为，饮鸩止渴，何如釜底抽薪？舍汤公之策，更无他法。”
史元**虽然素来猜忌段思廉，但目下各地叛乱令他应接不暇，段思廉抚慰河东成效显著，才干有目共睹，也算不可多得的的救世良才，暂且先用他救一时之急。待鸟尽兔死，再藏弓烹狗不迟。便道：“也罢，命内史拟敕，召樊子盖回京养病，改任段思廉为讨捕大使，平定绛郡之乱。且看成效如何。若不能胜，便将其扰乱纲纪之罪，一并责罚！”
有了朝廷正式任命，段思廉终于得以踢开樊子盖，独任剿匪战事。他一改樊子盖的清乡屠杀之策，公开处决了一批杀戮过重，民怨极大的官兵。并与刘弘毅等地方官员会商，事先制定了详细的招抚安置方案，布告全境：百姓被迫为盗，三十日内前来归顺者，尽赦其罪，田产享有如初，免本年徭役；擒得贼之头目来献者，论功行赏；犯****、抢掠、奸**重罪者，自首可减刑二等；家属遭官兵无辜屠戮或房舍土地毁于兵火者，悉可上报本地官府，按成例予以赔偿抚恤；无家可归，无田可耕者，就于太原附近分拨闲置土地为产，贷给农具粮种，免租调一年。三十日外仍不来归顺，视为顽抗，复罪如初，决不宽贷。同时集中有限的兵力，针对流寇中的死硬分子进行重点清剿打击。
以抚为主，剿抚并用，团结多数打击少数的宽大政策很快收到了预期效果。流亡的百姓对樊子盖的清乡之举心有余悸，初见布告，疑惧不敢前来，唯有少数人壮着胆子前来投顺、自首。段思廉言而有信，果然赦罪放还，照价补偿其损失。对一些无地流民，安置于太原附近。对犯有重罪的自首之人也如约予以减刑。
被迫跟从敬盘陀、柴保昌等造反的百姓闻段思廉言而有信，纷纷来投，如同雪球般越滚越多，一个月下来，基本上都回到了家乡或由段思廉安置到太原附近，还有数十名剽悍勇猛之士感激段思廉的活命之恩，自请在帐下效命。段思廉为避免他们受歧视，全部留在身边担任卫士。百姓闻之，深感汤公待人不疑，更加心悦诚服。敬盘陀、柴保昌等如鱼失水，在官军有组织、有针对性的打击下，很快土崩瓦解。柴保昌投降，敬盘陀兵败****。段思廉分兵清剿余部，到六月中旬，绛郡之乱全部平定。驰报朝廷，史元**下旨嘉奖，增邑二千户，命段思廉率得胜之师，会合云中郡守卫孝节、上党郡守李思行，合兵讨伐为患河东的甄翟儿。