想到清军不是沿着大道而来，却是从自己防御严密的小路前来，一时被打得措手不及。
清军攻克古牧地之后，迅速将乌鲁木齐的外围俄军据点一一肃清，最后，清军利用大炮，将乌鲁木齐的城墙轰倒，大清军从缺口处冲入城中，将守城的五千余俄军，全部歼灭。随后左宗棠命李锦棠守城，让金顺趁胜追击俄军。
清军气势如虹，一路穷追打，俄军根本没有办法稳住防线。加上此时的俄国大本营对于俄军到底该坚守大清的北疆，还是听从英法两国的建议，撤出北疆出现了几种不同的声音，俄国大本营对于北疆的俄军军事行动，一直没有明确的表态。
这使得俄军在北疆的行动，行止上无法统一，增援与要增援的人都无法对局势做出准确的叛断。清军一路之上，先后将被俄军占领的昌吉、呼图壁及玛纳斯北城。咸丰二十二年十一月六日，俄国大本营终于就俄军在大清新疆的军事行动做出了最终表决。
俄国政府希望能够借助英法两国的压力，最后坚守住玛纳斯南城，如此时间一托延下去，大清必定无法承担西北平叛的巨大消耗，最终只能无奈地坐下来，与俄国人和谈。俄国希望借此，与大清划出新的西北国境线，从而达到其彻底占领玛纳斯一带的目的。
金顺的大军攻击到玛纳斯的时候，遭到了俄军此战之中，前所未有的强烈抵抗。金顺在玛纳斯南城之下，强攻月余，损失巨大却一无所获。时已入冬，大雪即将来临。眼看着俄军的阴谋即将得逞。
左宗棠让还在清剿山中俄军残余部队的李锦棠部放弃清剿，迅速增援金顺。李锦常闻讯，率领大军急进增援，终于在大雪封山之时赶到玛纳斯南城，并与金顺一道将城中的俄军歼灭。俄军溃败，再无险可守，于当月退回俄国境内。至此，俄国的阴谋宣告泡汤。
咸丰二十三年初，大清政府对于俄国人三次入侵大清领土的无礼举动，作了反应。三月，大清外交部长李鸿章再次前往美国，争取到了美国人对于清俄战争的默认承诺。四月，大清政府宣布，对于俄国的无礼举动，大清将在日本沿海驱逐俄国太平舰队，并且再次出兵日本，对俄国在日本的势力彻底清除。
俄军太平洋舰队是一支俄军新建不久的舰队，为了能够尽快地壮大太平洋舰队。俄国人在日本疯狂建筑船厂，使俄军太平洋舰队的数量一度达到了数十余艘。其中仅战列舰便达到了惊人的五艘之多。
为了能够彻底的消灭俄军太平洋舰队，大清决意出动了北洋、东海以及太平洋舰队共大小战舰一百余艘，战列舰十艘，装甲巡洋舰二十五艘。这其中便有大清最新研发的新式“秦皇级“超级战列舰--飞扬号。
飞扬号，长达三百余料，宽一百余米，设计航速二十节，最大航速二十五节。最大排水量达到了惊人的二点六万吨，是当前世界上最大的战更舰。飞扬号战列舰采用了最新一火力中轴线设计，主炮由八门400多MM的三联装组成，其余还有副炮大小共二十四门。
面对如同海上巨无霸一般的飞扬号战列舰，俄军太平洋舰队的舰船，只能望洋兴叹。飞扬号坚硬的装甲厚度，让俄军战舰的炮弹仅仅只能在他的表面上炸起一个个小小的白点，却对他毫无办法。
但是所有被飞扬号轰中的俄军战舰，不是立马沉没海底，便是浓烟滚滚，狼狈逃蹿。俄军太平洋舰队在顽强抵抗了大清联合舰队长达半天的强攻猛打之后，损失了半数的战舰，一路疯狂向南急退，至此，俄军人在太平洋上苦心经营了十年之久的坚固保垒，被大清的舰队毁于一旦。
失去了军港的俄军太平洋舰队，只得如流浪狗一般地由英国的印度洋舰队接回巴尔各达港，过上寄人篱下的日子。
肃清了俄国在太平洋上的势力之后，大清立马便占据了俄国在日本经营许久的地盘，并开始了咸丰制定了十几年的分裂计划。大清政府再次向日本德咱幕府出售了一批大军淘汰下来的武器弹药之后，大力鼓动了德川幕府对盘踞在长州藩一带的日本天皇一党势力进行打击。其目的便是逼迫英国从日本退兵。
咸丰二十三年夏，英国政府在与大清商谈之下，决定撤出日本的驻军，并将日本的长州藩地区移交给大清政府管理。英国政府为此，得到了大清一纸在将来有可能出现的世界大战之中，在没有大清自身没有受到协约国一方的危害之前，不向与德国同盟的约定。