复产生了融合癌基因,如BCR-ABL或-RUNX1,它们是在多种癌症中发现的有文献证明的驱动因素和新抗原。鉴于RT过程中大量的DNA损伤可能促进Alt-EJ的修复,我们提出类似于上述例子的染色体重排可能远隔外肿瘤缓解期间产生免疫靶新抗原。
?新抗原的另一个常见来源是导致肽序列改变的基因突变。这包括导致肿瘤特异性氨基酸变化的错义突变。与这种序列变化相对应的肽在癌症中被识别,并且已经记录了针对这种突变蛋白质的CTL介导的抗肿瘤免疫反应。错义突变与远隔抗肿瘤免疫反应有关。例如,过继转移b-Raf中一个点突变的特异性CTL导致远隔效应削弱。在其他情况下,突变蛋白也过度表达,可能有助于增强其免疫原性。
?错义突变不是导致新抗原肽的唯一遗传变化。例如,错配修复(MMR)缺陷与对ICI的强烈反应密切相关,并且PD-1拮抗剂被批准用于微卫星不稳定的癌症,而与来源组织无关。这是对癌症治疗的首次“肿瘤不可知论”认同,在这类患者中,移码突变可以预测反应,表明这种形式的基因组不稳定性在产生新抗原方面特别活跃。有趣的是,最近的研究表明,在MMR缺乏的情况下,以关键MMR蛋白MHL1的缺失为模型的抗肿瘤免疫可能涉及DSB的过度末端切除和异常DNA修复中间产物,这些中间产物会错分为微核,并通过如上所述的CGA/STING进行检测。然而,考虑到其他MMR因素,包括MHS2和MHS6,也可以预测患者ICI治疗后的抗肿瘤免疫反应,高突变负荷仍然是这种现象的主要促成因素更为合理。对各种癌症类型的系统分析表明,小的INDEL也会产生很大比例的新抗原。事实上,MMR缺陷癌症的移码突变与新抗原的产生有关。无论如何,在RT诱导的远隔效应缓解期间,这些序列变化的根本原因是DNA损伤。NHEJ和AltEJ的维修经常产生小的INDEL。
?因此,通过修复大量RT诱导的损伤而产生的改变的肽序列是远隔发生期间新抗原的另一个来源。这种免疫原性表位很可能补充通过替代方法产生的新抗原,这些新抗原在很大程度上独立于受损的DNA及其随后的修复。这包括由于选择性剪接而改变的肽序列,我们引导感兴趣的读者阅读最近关于这个主题的详尽综述。
Fig3.DNA损伤产生新抗原的机制。
受损的DNA可能是基因间的,也可能是基因和启动子序列之间的。在药物损伤或HR缺乏时,受损的DNA可通过末端连接途径修复(左侧)。由于AltEJ和MMR导致修复部位的小indels,因此这种修复与序列变化有关。除此之外,NHEJ的修复涉及到诸如Artemis等因素的末端处理,这也导致交界部位的小片段变化。总之,这种修复机制导致修复部位的核苷酸序列发生变化。由此产生的错义突变
能够引起氨基酸序列的变化,从而产生新抗原。在互补或替代机制中,两个不同位点的DNA断裂可能导致启动子易位和特定抗原的异常过度表达(右侧)。这些途径可能不是排他性事件,并可能在远隔效应期间产生免疫系统靶向的肿瘤新抗原。
亮点:
1.本文综述了感知自身核苷酸是导致远隔效应的免疫反应的初始触发因素;
2.由细胞质自身核苷酸引发的I型炎症改变了肿瘤微环境,从而允许新抗原的呈现;
3.天然免疫PRR靶向激动剂及其下游分子的出现,提出相关药物在治疗多种恶性肿瘤的临床前表现出很大的前景。
疑问:
1.新抗原的起源并未完全明确;
2.预测远隔效应是否存在分子标志物未能探讨;
启发:
1.肿瘤的新抗原应该如何研究?
2.放疗+免疫导致的不良反应增加是否也与自身核苷酸有关?
根据目前免疫标记物的检测策略,对ICIs的反应仍然是异质性的。一些晚期非小细胞肺癌患者在最初诊断时未发现转移,最终在手术后疾病进展过程中发生转移。
异时性转移患者通常表现为多发性远处转移,大多数患者在开始ICIs治疗前已接受系统治疗,如酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)、化疗或放疗(RT)。
新的研究表明,在接受新辅助治疗的NSCLC患者中,治疗方案可能会影响PD-L1的表达和肿瘤免疫环境的特征。
PD-L1表达和免疫细胞浸润的肿瘤异质性、多样性一直是免疫治疗领域关注的问题。肿瘤转移过程中可能发生肿瘤免疫微环境(TIME)的动态演变。在一定比例的转移性肿瘤(MTs)和相应的原发性肿瘤(PTs)之间, PD-L1表达存在差异。
评估MTS与相应PTS的肿瘤免疫背景可能揭示NSCLC转移过程中免疫标记物的变化。一个主要的挑战是,此类研究受到实际临床过程的限制,在实际临床过程中,活检样本可能无法显示令人满意的免疫微环境全景图,这可能导致活检和手术标本之间肿瘤内异质性的偏差。
在这项研究中,我们收集了成对的手术切除的原发性和转移性样本,以避免活检中潜在的异质性。我们利用多重免疫荧光(MF)和数字图像分析定量鉴定NSCLC中PD-L1的表达和肿瘤浸润性淋巴细胞(TLL)。
28例样本,8例有两处转移,共64个样本。14例肺内转移,22例肺外转移
NSCLC原发和转移部位中PD-L1表达和TIL的异质性
原发性和转移性NSCLC肿瘤中每个细胞亚群的mIF染色的代表性图像如图1A所示。结果表明,MTs通常在PD-L1+细胞群中具有较高的PD-L1表达水平(p=0.042)和较高的TPS(中位数:29.16%vs18.50%;平均值:42.34%vs35.91%,p=0.096)。MTs中较低密度的CD8+CTL(p=0.022)具有显著性差异,但未发现ICs到TCs的空间距离存在统计学差异。使用符号秩检验确定配对PTs和MTs之间定量免疫标记物的异质性。